Duas moléculas de Aminoácido podem se unir e formar uma ligação peptídica produzindo um dipepitídio. Na reação ocorre a liberação de uma molécula de água. Quando uns poucos aminoácidos são unidos dessa maneira, a estrutura formada é chamada de oligopeptídio. Quando muitos aminoácidos são unidos, o produto é chamado de um polipeptídio. Polipeptídios geralmente possuem um peso molecular abaixo de 10.000, e aquelas chamadas proteínas possuem pesos moleculares maiores.
Em um peptídio, o resíduo de aminoácido na extremidade com o grupo amino é chamado de resíduo terminal amino (ou N-terminal); o termnal quie possui o grupo carboxila livre é o resíduo terminal carboxila (ou C-terminal).
Algumas proteínas consistem de uma ceia polipeptídica única, mas outras, chamadas de proteínas subunidades múltiplas, possuem dois ou mais peptídios associados de forma não-covalente. As cadeias polipeptídicas individuais em uma proteína de subunidades múltipla podem ser idênticas ou diferentes. Se pelo menos duas são idênticas, a proteína é dita OLIGOMÉRICA, e as unidades idênticas (consistindo de uma ou mais cadeias de polipeptídios) são referidas como protômeros.
Algumas proteínas contêm permanentemente associados outros componentes químicos além dos aminoácidos; essas são chamadas de PROTEÍNAS CONJUGADAS. A parte não-aminoácido de uma proteína conjugada é usualmente chamada de seu grupo prostético. Proteínas conjugadas são classificadas com base na natureza química dos seus grupos prostéticos:
Classe | Grupo prostético | Exemplo
Lipoproteínas | Lipídios | Beta1- lipoproteína do sangue
Glicoproteínas | Carboidratos | Imunoglobulina G
Fosfoproteínas | Grupos fosfatos | Caseína do Leite
Hemoproteínas | Heme (porfirina da ferro) | Hemoglobina
Flavoproteínas | Nucleotídíos de Flavina | Desidrogenase succínica
Metaloproteínas | Ferro | Ferritina
Zinco | Desidrogenase alcoólica
Cálcio | Calmodulina
Molibdênio | Dinitrogenase
Cobre | Plastocianina
Fonte: Princípios de Química, Lehninger , Quarta edição
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